Juan arrestado en su viaje al sur 

Cuando Jesús regresó de su Cuarenta días en el desierto, se dirigió hacia el norte, de vuelta a Galilea. Alrededor de una cuarta parte de los discípulos de Juan decidieron seguir a Jesús. Pero Juan sintió que lo llevaban hacia el sur, hacia el lugar donde había Juan comienza a predicar y a bautizar. Así pues, el domingo 3 de marzo de 26 EC, Juan, con el resto de sus discípulos, partió hacia el sur. Por el camino, Juan siguió predicando y bautizando. Pero el tenor de su predicación había cambiado desde que bautizó a Jesús. Sentía que su misión estaba llegando a su fin; que el reino venidero ya no era su responsabilidad. Al darse cuenta de ello, Juan se sintió desanimado y solo. Sin embargo, perseveró en su viaje. En una de las ciudades de su viaje, Juan hizo su famoso ataque a Herodes Antipas, que había tomado la esposa de otro hombre.

En junio de este año, Juan había regresado al lugar donde había comenzado más de un año antes: el vado de Betania. Juan ya no era el predicador incendiario que había sido al principio; su enseñanza se centraba ahora en la misericordia para con el hombre común. Pero su vehemencia se manifestó en una mayor condena de la corrupción de los gobernantes políticos y religiosos.

Juan estaba predicando en los dominios de Herodes Antipas, y Herodes se preocupó por las cosas que Juan decía. Temía que Juan pudiera provocar una rebelión, y también estaba profundamente resentido por el hecho de que Juan criticara tanto sus arreglos domésticos. La respuesta de Herodes fue Juan el Bautista en la cárcel. Y así, temprano en la mañana del 12 de junio de 26 EC, Herodes envió a sus agentes y puso a Juan bajo arresto.

Cuando habían pasado unas semanas y Juan no había sido liberado, los discípulos que quedaban de Juan se dispersaron por Palestina. Muchos de ellos fueron a Galilea para unirse a Jesús y sus seguidores.